Magyar ådrog sig en hjärnskakning och förlorade tillfälligt känseln i benen under HBK:s allsvenska förlustmatch mot IFK Göteborg i torsdags.
I stället kallas Hammarbys Marcus Törnstrand in i U21-truppen, uppger Svenska fotbollförbundet.
U21-landslaget möter Norge borta den 2 juni och Serbien i Falkenberg den 6 juni.